В годы сталинских репрессий раввин Л.-И.Шнеерсон всячески поддерживал религиозную жизнь евреев Днепропетровска. Призывал не отступать от законов иудаизма, оставаться верными традициям еврейского народа. В 1939 году был арестован за «религиозную деятельность и антисоветскую пропаганду», сослан в Казахстан, в поселок Шиели Кызылординской области. Находясь в ссылке, до конца своих дней продолжал деятельность раввина, учился Торе сам и обучал других. Умер в 1944 году, похоронен в Алматы. В 1989 году был реабилитирован. 19 декабря 1999 года Президент РК Нурсултан Назарбаев лично передал три тома материалов дела Л.-И.Шнеерсона из архивов КНБ библиотеке Любавичского Ребе в Нью-Йорке.
Центральная синагога Казахстана носит имя раввина Леви-Ицхака Шнеерсона. Первый камень здания был заложен в годовщину его смерти. Торжества, проходящие в Алматы, являются важными для евреев всего мира. В церемонии участвуют члены казахстанской еврейской общины, иностранные гости, приехавшие в Алматы, чтобы помолиться на могиле праведника и отметить этот день.
